・潜水艦は第一・第二ともに旗艦不可
・渦潮の電探は渦潮毎に「第一艦隊の数だけ」「それぞれ個別に」の2種類が設定されている
・航空戦は第一艦隊のみ参加。第二艦隊は艦攻類が撃墜されないが制空値、彩雲等の効果もない。偵察機含む熟練度上昇も同様
・対空カットインは第一・第二どちらでも可。防空参加も可能(=艦隊防空の上がる装備はどこに持っても有効)
・戦艦系で砲撃戦が二巡するのは第一艦隊のみ
・雷撃戦は開幕・終了時ともに第二艦隊のみ
・夜戦は第二艦隊固定。夜戦マスも同様。夜戦マスの場合は陣形が通常艦隊のものになる
・いずれの夜戦でも潜水艦の夜戦カスダメ仕様は適用されない
・砲撃戦は水上打撃のみ第一が先。空母輸送は第二から。
・火力に以下の補正がかかる
(第一/第二) 空母機動部隊 砲撃+2/+10 雷撃--/-5 水上打撃部隊 砲撃+10/-5 雷撃--/-5 輸送護衛部隊 砲撃-5/+10 雷撃--/-5
水上打撃部隊
・第一艦隊
0-6 軽巡/雷巡 0-2 重巡/航巡 0-4 戦艦/航戦 ※上記3種で合計下限2 0-1 正規空母 0-2 軽空母 ※空母はどちらかのみ 0-4 他
・第二艦隊
1-1 軽巡 (旗艦でなくても良い) 2-5 駆逐 0-2 重巡/航巡 0-1 水母/軽空 0-2 高速戦艦 0-3 他
空母機動部隊
・第一艦隊
2-4 空母(軽含) 0-2 戦艦 0-4 他
・第二艦隊
水上打撃と同じ